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A项，用人单位和劳动者签订合同时，用人单位处于相对优势地位，二者形成的关系受劳动合同法调整，故劳动合同不适用合同法规定，而适用特别法即劳动合同法调整，该选项错误。

B项，税务机关在行使行政职权时，与纳税者并非平等主体，二者形成行政法律关系，该选项错误。

C项，发包人与设计单位之间的关系为平等主体之间的工程设计合同，受民法调整，该选项正确。

D项，专利授权机关决定是否授予专利权时，是在行使行政职权，与专利申请人之间并非平等关系。申请人不服专利授权机关决定的，可以提起行政诉讼，该选项错误。综上，本题的正确答案为C。

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